/*
 * Code generated from Atmel Start.
 *
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 * to avoid losing it when reconfiguring.
 */

#include "driver_init.h"
#include <peripheral_clk_config.h>
#include <utils.h>
#include <hal_init.h>

struct qspi_dma_descriptor ECAT_QSPI;

struct spi_m_dma_descriptor SPI_M2;

struct spi_m_dma_descriptor SPI_M1;

struct spi_m_dma_descriptor SPI_M3;

void EXTERNAL_IRQ_0_init(void)
{
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, EIC_GCLK_ID, CONF_GCLK_EIC_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
	hri_mclk_set_APBAMASK_EIC_bit(MCLK);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(SPI_M1_SS, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(SPI_M1_SS,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(SPI_M1_SS, PINMUX_PA18A_EIC_EXTINT2);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(SPI_M2_SS, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(SPI_M2_SS,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(SPI_M2_SS, PINMUX_PA06A_EIC_EXTINT6);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(SPI_M3_SS, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(SPI_M3_SS,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(SPI_M3_SS, PINMUX_PA14A_EIC_EXTINT14);

	ext_irq_init();
}

void EVENT_SYSTEM_0_init(void)
{
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, EVSYS_GCLK_ID_0, CONF_GCLK_EVSYS_CHANNEL_0_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));

	hri_mclk_set_APBBMASK_EVSYS_bit(MCLK);

	event_system_init();
}

void ECAT_QSPI_PORT_init(void)
{

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(PB11, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(PB11,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PB11, PINMUX_PB11H_QSPI_CS);

	gpio_set_pin_direction(PA08,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(PA08,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA08,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA08,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA08H_QSPI_DATA0"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA08H_QSPI_DATA0);

	gpio_set_pin_direction(PA09,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(PA09,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA09,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA09,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA09H_QSPI_DATA1"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA09H_QSPI_DATA1);

	gpio_set_pin_direction(PA10,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(PA10,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA10,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA10,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA10H_QSPI_DATA2"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA10H_QSPI_DATA2);

	gpio_set_pin_direction(PA11,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(PA11,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA11,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA11,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA11H_QSPI_DATA3"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA11H_QSPI_DATA3);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(PB10, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(PB10,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PB10, PINMUX_PB10H_QSPI_SCK);
}

void ECAT_QSPI_CLOCK_init(void)
{
	hri_mclk_set_AHBMASK_QSPI_bit(MCLK);
	hri_mclk_set_AHBMASK_QSPI_2X_bit(MCLK);
	hri_mclk_set_APBCMASK_QSPI_bit(MCLK);
}

void ECAT_QSPI_init(void)
{
	ECAT_QSPI_CLOCK_init();
	qspi_dma_init(&ECAT_QSPI, QSPI);
	ECAT_QSPI_PORT_init();
}

void SPI_M2_PORT_init(void)
{

	gpio_set_pin_level(PA04,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(PA04, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(PA04, PINMUX_PA04D_SERCOM0_PAD0);

	gpio_set_pin_level(PA05,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(PA05, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(PA05, PINMUX_PA05D_SERCOM0_PAD1);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(PA07, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA07,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA07, PINMUX_PA07D_SERCOM0_PAD3);
}

void SPI_M2_CLOCK_init(void)
{
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM0_GCLK_ID_CORE, CONF_GCLK_SERCOM0_CORE_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM0_GCLK_ID_SLOW, CONF_GCLK_SERCOM0_SLOW_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));

	hri_mclk_set_APBAMASK_SERCOM0_bit(MCLK);
}

void SPI_M2_init(void)
{
	SPI_M2_CLOCK_init();
	spi_m_dma_init(&SPI_M2, SERCOM0);
	SPI_M2_PORT_init();
}

void SPI_M1_PORT_init(void)
{

	gpio_set_pin_level(PA16,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(PA16, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(PA16, PINMUX_PA16C_SERCOM1_PAD0);

	gpio_set_pin_level(PA17,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(PA17, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(PA17, PINMUX_PA17C_SERCOM1_PAD1);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(PA19, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA19,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA19, PINMUX_PA19C_SERCOM1_PAD3);
}

void SPI_M1_CLOCK_init(void)
{
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM1_GCLK_ID_CORE, CONF_GCLK_SERCOM1_CORE_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM1_GCLK_ID_SLOW, CONF_GCLK_SERCOM1_SLOW_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));

	hri_mclk_set_APBAMASK_SERCOM1_bit(MCLK);
}

void SPI_M1_init(void)
{
	SPI_M1_CLOCK_init();
	spi_m_dma_init(&SPI_M1, SERCOM1);
	SPI_M1_PORT_init();
}

void SPI_M3_PORT_init(void)
{

	gpio_set_pin_level(PA12,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(PA12, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(PA12, PINMUX_PA12C_SERCOM2_PAD0);

	gpio_set_pin_level(PA13,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(PA13, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(PA13, PINMUX_PA13C_SERCOM2_PAD1);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(PA15, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA15,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA15, PINMUX_PA15C_SERCOM2_PAD3);
}

void SPI_M3_CLOCK_init(void)
{
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM2_GCLK_ID_CORE, CONF_GCLK_SERCOM2_CORE_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM2_GCLK_ID_SLOW, CONF_GCLK_SERCOM2_SLOW_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));

	hri_mclk_set_APBBMASK_SERCOM2_bit(MCLK);
}

void SPI_M3_init(void)
{
	SPI_M3_CLOCK_init();
	spi_m_dma_init(&SPI_M3, SERCOM2);
	SPI_M3_PORT_init();
}

void TIMER_1_CLOCK_init(void)
{
	hri_mclk_set_APBAMASK_TC0_bit(MCLK);

	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, TC0_GCLK_ID, CONF_GCLK_TC0_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
}

void system_init(void)
{
	init_mcu();

	// GPIO on PB22

	gpio_set_pin_direction(PB22,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(PB22,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(PB22,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PB22,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      GPIO_PIN_FUNCTION_M);

	// GPIO on PB23

	gpio_set_pin_direction(PB23,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(PB23,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(PB23,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PB23,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      GPIO_PIN_FUNCTION_M);

	EXTERNAL_IRQ_0_init();

	EVENT_SYSTEM_0_init();

	ECAT_QSPI_init();

	SPI_M2_init();

	SPI_M1_init();

	SPI_M3_init();

	TIMER_1_CLOCK_init();

	TIMER_1_init();
}
