/*
 * Code generated from Atmel Start.
 *
 * This file will be overwritten when reconfiguring your Atmel Start project.
 * Please copy examples or other code you want to keep to a separate file
 * to avoid losing it when reconfiguring.
 */

#include "driver_init.h"
#include <peripheral_clk_config.h>
#include <utils.h>
#include <hal_init.h>

struct qspi_sync_descriptor QUAD_SPI_0;

struct usart_sync_descriptor TARGET_IO;

struct spi_m_dma_descriptor SPI_0;

struct spi_m_dma_descriptor SPI_1;

void EVENT_SYSTEM_0_init(void)
{
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, EVSYS_GCLK_ID_0, CONF_GCLK_EVSYS_CHANNEL_0_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));

	hri_mclk_set_APBBMASK_EVSYS_bit(MCLK);

	event_system_init();
}

void QUAD_SPI_0_PORT_init(void)
{

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(PB11, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(PB11,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PB11, PINMUX_PB11H_QSPI_CS);

	gpio_set_pin_direction(PA08,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(PA08,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA08,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA08,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA08H_QSPI_DATA0"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA08H_QSPI_DATA0);

	gpio_set_pin_direction(PA09,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(PA09,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA09,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA09,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA09H_QSPI_DATA1"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA09H_QSPI_DATA1);

	gpio_set_pin_direction(PA10,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(PA10,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA10,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA10,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA10H_QSPI_DATA2"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA10H_QSPI_DATA2);

	gpio_set_pin_direction(PA11,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(PA11,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(PA11,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PA11,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA11H_QSPI_DATA3"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA11H_QSPI_DATA3);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(PB10, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(PB10,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PB10, PINMUX_PB10H_QSPI_SCK);
}

void QUAD_SPI_0_CLOCK_init(void)
{
	hri_mclk_set_AHBMASK_QSPI_bit(MCLK);
	hri_mclk_set_AHBMASK_QSPI_2X_bit(MCLK);
	hri_mclk_set_APBCMASK_QSPI_bit(MCLK);
}

void QUAD_SPI_0_init(void)
{
	QUAD_SPI_0_CLOCK_init();
	qspi_sync_init(&QUAD_SPI_0, QSPI);
	QUAD_SPI_0_PORT_init();
}

void TARGET_IO_PORT_init(void)
{

	gpio_set_pin_function(PB25, PINMUX_PB25D_SERCOM2_PAD0);

	gpio_set_pin_function(PB24, PINMUX_PB24D_SERCOM2_PAD1);
}

void TARGET_IO_CLOCK_init(void)
{
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM2_GCLK_ID_CORE, CONF_GCLK_SERCOM2_CORE_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM2_GCLK_ID_SLOW, CONF_GCLK_SERCOM2_SLOW_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));

	hri_mclk_set_APBBMASK_SERCOM2_bit(MCLK);
}

void TARGET_IO_init(void)
{
	TARGET_IO_CLOCK_init();
	usart_sync_init(&TARGET_IO, SERCOM2, (void *)NULL);
	TARGET_IO_PORT_init();
}

void SPI_0_PORT_init(void)
{

	gpio_set_pin_level(PB27,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(PB27, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(PB27, PINMUX_PB27D_SERCOM4_PAD0);

	gpio_set_pin_level(PB26,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(PB26, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(PB26, PINMUX_PB26D_SERCOM4_PAD1);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(PB29, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(PB29,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PB29, PINMUX_PB29D_SERCOM4_PAD3);
}

void SPI_0_CLOCK_init(void)
{
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM4_GCLK_ID_CORE, CONF_GCLK_SERCOM4_CORE_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM4_GCLK_ID_SLOW, CONF_GCLK_SERCOM4_SLOW_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));

	hri_mclk_set_APBDMASK_SERCOM4_bit(MCLK);
}

void SPI_0_init(void)
{
	SPI_0_CLOCK_init();
	spi_m_dma_init(&SPI_0, SERCOM4);
	SPI_0_PORT_init();
}

void SPI_1_PORT_init(void)
{

	gpio_set_pin_level(PB16,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(PB16, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(PB16, PINMUX_PB16C_SERCOM5_PAD0);

	gpio_set_pin_level(PB17,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(PB17, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(PB17, PINMUX_PB17C_SERCOM5_PAD1);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(PB01, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(PB01,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(PB01, PINMUX_PB01D_SERCOM5_PAD3);
}

void SPI_1_CLOCK_init(void)
{
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM5_GCLK_ID_CORE, CONF_GCLK_SERCOM5_CORE_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM5_GCLK_ID_SLOW, CONF_GCLK_SERCOM5_SLOW_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));

	hri_mclk_set_APBDMASK_SERCOM5_bit(MCLK);
}

void SPI_1_init(void)
{
	SPI_1_CLOCK_init();
	spi_m_dma_init(&SPI_1, SERCOM5);
	SPI_1_PORT_init();
}

void TIMER_0_CLOCK_init(void)
{
	hri_mclk_set_APBAMASK_TC0_bit(MCLK);

	hri_mclk_set_APBAMASK_TC1_bit(MCLK);
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, TC0_GCLK_ID, CONF_GCLK_TC0_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
}

void TC_ECAT_CLOCK_init(void)
{
	hri_mclk_set_APBDMASK_TC7_bit(MCLK);
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, TC7_GCLK_ID, CONF_GCLK_TC7_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
}

void system_init(void)
{
	init_mcu();

	// GPIO on PB00

	gpio_set_pin_level(ECAT_SPI_CS_PIN,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(ECAT_SPI_CS_PIN, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(ECAT_SPI_CS_PIN, GPIO_PIN_FUNCTION_OFF);

	// GPIO on PB28

	gpio_set_pin_level(SPI_CS,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   true);

	// Set pin direction to output
	gpio_set_pin_direction(SPI_CS, GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_function(SPI_CS, GPIO_PIN_FUNCTION_OFF);

	EVENT_SYSTEM_0_init();

	QUAD_SPI_0_init();

	TARGET_IO_init();

	SPI_0_init();

	SPI_1_init();

	TIMER_0_CLOCK_init();

	TIMER_0_init();

	TC_ECAT_CLOCK_init();

	TC_ECAT_init();
}
