/*
 * Code generated from Atmel Start.
 *
 * This file will be overwritten when reconfiguring your Atmel Start project.
 * Please copy examples or other code you want to keep to a separate file
 * to avoid losing it when reconfiguring.
 */

#include "driver_init.h"
#include <peripheral_clk_config.h>
#include <utils.h>
#include <hal_init.h>

struct qspi_dma_descriptor QSPI_INSTANCE;

struct usart_sync_descriptor TARGET_IO;

void QSPI_INSTANCE_PORT_init(void)
{

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(FLASH_CS, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(FLASH_CS,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(FLASH_CS, PINMUX_PB11H_QSPI_CS);

	gpio_set_pin_direction(FLASH_IO0,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(FLASH_IO0,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(FLASH_IO0,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(FLASH_IO0,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA08H_QSPI_DATA0"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA08H_QSPI_DATA0);

	gpio_set_pin_direction(FLASH_IO1,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(FLASH_IO1,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(FLASH_IO1,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(FLASH_IO1,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA09H_QSPI_DATA1"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA09H_QSPI_DATA1);

	gpio_set_pin_direction(FLASH_IO2,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(FLASH_IO2,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(FLASH_IO2,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(FLASH_IO2,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA10H_QSPI_DATA2"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA10H_QSPI_DATA2);

	gpio_set_pin_direction(FLASH_IO3,
	                       // <y> Pin direction
	                       // <id> pad_direction
	                       // <GPIO_DIRECTION_OFF"> Off
	                       // <GPIO_DIRECTION_IN"> In
	                       // <GPIO_DIRECTION_OUT"> Out
	                       GPIO_DIRECTION_OUT);

	gpio_set_pin_level(FLASH_IO3,
	                   // <y> Initial level
	                   // <id> pad_initial_level
	                   // <false"> Low
	                   // <true"> High
	                   false);

	gpio_set_pin_pull_mode(FLASH_IO3,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(FLASH_IO3,
	                      // <y> Pin function
	                      // <id> pad_function
	                      // <i> Auto : use driver pinmux if signal is imported by driver, else turn off function
	                      // <PINMUX_PA11H_QSPI_DATA3"> Auto
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_OFF"> Off
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_A"> A
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_B"> B
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_C"> C
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_D"> D
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_E"> E
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_F"> F
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_G"> G
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_H"> H
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_I"> I
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_J"> J
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_K"> K
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_L"> L
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_M"> M
	                      // <GPIO_PIN_FUNCTION_N"> N
	                      PINMUX_PA11H_QSPI_DATA3);

	// Set pin direction to input
	gpio_set_pin_direction(FLASH_CLK, GPIO_DIRECTION_IN);

	gpio_set_pin_pull_mode(FLASH_CLK,
	                       // <y> Pull configuration
	                       // <id> pad_pull_config
	                       // <GPIO_PULL_OFF"> Off
	                       // <GPIO_PULL_UP"> Pull-up
	                       // <GPIO_PULL_DOWN"> Pull-down
	                       GPIO_PULL_OFF);

	gpio_set_pin_function(FLASH_CLK, PINMUX_PB10H_QSPI_SCK);
}

void QSPI_INSTANCE_CLOCK_init(void)
{
	hri_mclk_set_AHBMASK_QSPI_bit(MCLK);
	hri_mclk_set_AHBMASK_QSPI_2X_bit(MCLK);
	hri_mclk_set_APBCMASK_QSPI_bit(MCLK);
}

void QSPI_INSTANCE_init(void)
{
	QSPI_INSTANCE_CLOCK_init();
	qspi_dma_init(&QSPI_INSTANCE, QSPI);
	QSPI_INSTANCE_PORT_init();
}

void TARGET_IO_PORT_init(void)
{

	gpio_set_pin_function(PB25, PINMUX_PB25D_SERCOM2_PAD0);

	gpio_set_pin_function(PB24, PINMUX_PB24D_SERCOM2_PAD1);
}

void TARGET_IO_CLOCK_init(void)
{
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM2_GCLK_ID_CORE, CONF_GCLK_SERCOM2_CORE_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));
	hri_gclk_write_PCHCTRL_reg(GCLK, SERCOM2_GCLK_ID_SLOW, CONF_GCLK_SERCOM2_SLOW_SRC | (1 << GCLK_PCHCTRL_CHEN_Pos));

	hri_mclk_set_APBBMASK_SERCOM2_bit(MCLK);
}

void TARGET_IO_init(void)
{
	TARGET_IO_CLOCK_init();
	usart_sync_init(&TARGET_IO, SERCOM2, (void *)NULL);
	TARGET_IO_PORT_init();
}

void system_init(void)
{
	init_mcu();

	QSPI_INSTANCE_init();

	TARGET_IO_init();
}
